Но, как и в правлении предыдущих династий, вторая половина периода правления династии Мин стала кризисной. В конце 15 века начались изменения в экономике, поменялась социальная структура страны.

Рост населения привел к увеличению безземельных крестьян, а скупившие земли бедняков богачи зачастую не платили налогов. Таким образом, началось сокращение доходов в казну. Прибавим к этому слабовольных императоров неспособных к реформам, пришедших после Чжу Ди, и станет видно, что выхода из кризиса практически не существовало.

Наиболее показательным является правление императора Ваньли. Если в начале правления он старался быть мудрым правителем, окруженным образованными советниками, то к концу правления он предпочитал вообще не заниматься государственными делами, отдав практически всю власть в руки евнухов.

Такая ситуация продолжилась и при следующем императоре. Власть евнухов была свергнута только в 1928 году, но было уже поздно. Когда вспыхнуло очередное крестьянское восстание, Минские правители не могли уже противостоять ему. Обратившись за помощью к маньчжурам они, по сути, потеряли власть над страной.